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• 村上祐介「行政組織の必置緩和と地方政府の制度選択」日本政治学会編『年報政治学』，2008年第Ⅱ号，37-58頁．

政府間ガバナンスの変容 (年報政治学)

• 村上祐介「地方分権改革後の自治体教育政策の展開」『TOYONAKAビジョン22』vol.12，2009年1月，28-33頁．
• 村上祐介「教育委員会活性化論と廃止論の共通点」『愛媛法学会雑誌』第35巻1・2・3・4合併号，2009年3月，155-177頁．
• 村上祐介「道州制の下での基礎自治体の在り方と道州・市町村関係」『地域創成研究年報』第4号，2009年3月，69-75頁．
• 村上祐介「教育改革の政治過程」岡田浩・松田憲忠『現代日本の政治』（ミネルヴァ書房，2009年），240−255頁．

現代日本の政治―政治過程の理論と実際

• 村上祐介「教育委員会制度の展望と社会教育行政研究の課題」『日本社会教育学年報』第53集，2009年9月，167-179頁．
• 村上祐介「教育委員会制度改革論議の再検討」『日本社会教育行政学年報』第35号，2009年10月，231-234頁．
• 村上祐介「教育行政の『政治化』と『閉鎖性』をめぐって」『日本社会教育行政学年報』第35号，2009年10月，235-238頁．
• 村上祐介「教育行政の制度原理に関する研究動向」『教育制度学研究』第16号，2009年11月．132-137頁．
• 村上祐介「政権交代と教育委員会制度のゆくえ」『季刊教育法』第163号，2009年12月，28-33頁．
• 村上祐介「自治体の統治システム」村松岐夫編著『テキストブック地方自治（第2版）』（東洋経済新報社，2010年），63-88頁．

テキストブック地方自治 第2版

村上祐介先生より，2008年12月から2010年2月迄に公刊されました御高論を，ご恵与賜りました．ありがとうございました．
教育に関する行政分野は，皆目不案内の下名にとっては，村上先生の御高論を通じて，常々，勉強の機会を頂いておりました．この度賜りました，教育学会，教育行政学会，政治学会，行政学会，そして，自治業界を縦横無尽に，高質かつ安定的にご執筆された各御高論の数々に一重に驚かせていただきました．この度賜りました各御高論を，改めて謹んで，拝読をさせて頂ければと存じております．
心より御礼を申し上げます．誠にありがとうございました.